BLOGGER TEMPLATES AND TWITTER BACKGROUNDS »

Senin, 10 Juni 2013

Kecil, tetapi Mematikan

Mungkin banyak orang yang bertanya mengapa penulis memilih judul diatas. Kecil, tetapi mematikan, tentunya ungkapan tersebut sangat sesuai untuk disandangkan pada makhluk mungil yang sering kali menghisap darah, (bukan drakula) melainkan nyamuk.

Berbagai spesies nyamuk tersebar hampir di seluruh  belahan dunia. Sebagian dari spesies tersebut ada yang dapat menyebabkan manusia me-ngidap penyakit yang cukup serius. Pada kesempatan kali ini, penulis ber-maksud membahas mengenai salah satu spesies nyamuk yang dapat me-nimbulkan penyakit demam berdarah pada manusia, yaitu nyamuk aedes aegypti.

Ciri-ciri nyamuk aedes aegypti memiliki warna belang hitam putih di sekujur tubuh, yang terlihat jelas di bagian punggung. Pada aedes aegypti, corak bintik putih membentuk siku di bagian pinggiran tubuh.

Sebenarnya nyamuk ini tidak menyebabkan penyakit secara langsung pada tubuh manusia, melainkan karna virus dengan nama latin dangue, yang dibawa oleh nyamuk tersebut dapat ditularkan melalui gigitannya. Demam berdarah (DB) adalah penyakit demam akut yang disebabkan oleh nyamuk tersebut. Penyakit ini ditandai dengan demam tinggi mendadak, tanpa sebab yang jelas, dan biasanya berlangsung terus-menerus selama 2 hingga 7 hari.
Tidak jarang penyakit demam berdarah ini merenggut nyawa seseorang di-sebabkan oleh terlambatnya penanganan penyakit ini.

Demam pada DB mempunyai siklus yang unik serta dikenal dengan “Siklus Pelana Kuda”.  Siklus tersebut terbagi atas tiga fase. Fase pertama adalah tahapan di mana penderita DB akan mengalami panas yang sangat tinggi antara 1-3 hari kemudian fase kedua adalah fase dimana demam akan turun secara drastis dan sering mengecoh karena seolah-oleh terjadi kesem-buhan, padahal pada kenyataannya fase ini merupakan titik kritis dari pe-nyakit tersebut. Fase ini terjadi di hari 4-5. dan fase ketiga adalah fase pe-nyembuhan di hari ke 6- dan 7. Siklus tersebut memang benar adanya kare-na penulis pernah mengalami  secara langsung. Untuk itu, jika di antara kita ada yang menujukan gejala seperti yang telah dibahas sebelumnya,  sebaik-nya kita langsung membawanya ke dokter atau rumah sakit agar dapat lang-sung ditangani guna mencegah terjadinya hal yang tidak diinginkan.

Agar penyakit tersebut tidak terjadi pada kita, sebaiknya kita melakukan upaya pencegahan dengan cara menjaga kebersihan lingkungan sekitar kita dan budayakanlah kebiasaan hidup sehat.

Hubungan antara Komputasi Modern dengan Paralel Processing

Komputasi Modern dan Parallel Processing memiliki kaitan yang cukup dekat di antara keduanya. Dimana keduanya memiliki fungsi yang hampir sama yaitu sama – sama mengandalkan kecepatan yang dihasilkan dalam men-yelesaikan suatu masalah. Contohnya seperti penyelesaian masalah secara manual yang dahulu digunakan sekarang diganti pemecahan masalahnya dengan atau secara komputasi modern yang terbukti dapat meningkatkan kinerja dalam penyelesaian masalah tersebut. Untuk lebih meningkatkan kinerja tersebut kita tentunya perlu meningkatkan kecepatan perangkat keras yang ada khususnya processor. Sedangkan untuk parallel processing adalah penggunaan beberapa processor (multiprocessor atau arsitektur komputer dengan banyak processor) yang menjadikan kinerja komputer semakin cepat.

Dalam proses komputasi yang menggunakan parallel processing biasanya menggunakan atau memanfaatkan beberapa komputer yang dihubungkan oleh sebuah jaringan untuk memecahkan masalah yang ada. Perintah atau instruksi pada proses ini dapat dijalankan secara bersamaan sehingga dapat mempercepat dalam penyelesaian masalah dibandingkan hanya mengguna-kan satu buah komputer saja. Penggunaan proses ini biasanya untuk men-agani masalah yang sangat besar namun untuk masalah yang kecil ,jika dili-hat dari segi biaya yang ada lebih baik menggunakan satu komputer saja karena diras cukup murah.




KOMPUTASI dan PARALEL PROCESSING

Komputasi paralel adalah salah satu teknik melakukan komputasi secara ber-samaan dengan memanfaatkan beberapa komputer independen secara ber-samaan. Ini umumnya diperlukan saat kapasitas yang diperlukan sangat be-sar, baik karena harus mengolah data dalam jumlah besar (di industri ke-uangan, bioinformatika, dll) ataupun karena tuntutan proses komputasi yang banyak. Kasus kedua umum ditemui di kalkulasi numerik untuk menyelesai-kan persamaan matematis di bidang fisika (fisika komputasi), kimia (kimia komputasi) dll.

Untuk melakukan berbagai jenis komputasi paralel diperlukan infrastruktur mesin paralel yang terdiri dari banyak komputer yang dihubungkan dengan jaringan dan mampu bekerja secara paralel untuk menyelesaikan satu masa-lah. Untuk digunakan perangkat lunak pendukung yang biasa disebut mid-dleware yang berperan mengatur distribusi antar titik dalam satu mesin pa-ralel. Selanjutnya pemakai harus membuat pemrograman paralel untuk me-realisasikan komputasi. Salah satu middleware yang asli dikembangkan di Indonesia adalah OpenPC yang dipelopori oleh GFTK LIPI dan dimplemen-tasikan di LIPI Public Center.

Pemrograman Paralel sendiri adalah teknik pemrograman komputer yang memungkinkan eksekusi perintah/operasi secara bersamaan. Bila komputer  yang digunakan secara bersamaan tersebut dilakukan oleh komputer-kom-puter terpisah yang terhubung dalam satu jaringan komputer, biasanya dise-but sistem terdistribusi. Bahasa pemrograman yang populer digunakan da-lam pemrograman paralel adalah MPI (Message Passing Interface) dan PVM (Parallel Virtual Machine).

Yang perlu diingat adalah komputasi paralel berbeda dengan multitasking. Pengertian multitasking adalah komputer dengan processor tunggal meng-eksekusi beberapa tugas secara bersamaan. Walaupun beberapa orang yang bergelut di bidang sistem operasi beranggapan bahwa komputer tunggal ti-dak bisa melakukan beberapa pekerjaan sekaligus, melainkan proses penjad-walan yang berlakukan pada sistem operasi membuat komputer seperti me-ngerjakan tugas secara bersamaan. Sedangkan komputasi paralel sudah di-jelaskan sebelumnya, bahwa komputasi paralel menggunakan beberapa pro-cessor atau komputer. Selain itu komputasi paralel tidak menggunakan arsi-tektur Von Neumann.

Untuk lebih memperjelas lebih dalam mengenai perbedaan komputasi tung-gal (menggunakan 1 processor) dengan komputasi paralel (menggunakan beberapa processor), maka kita harus mengetahui terlebih dahulu pengertian mengenai model dari komputasi. Ada 4 model komputasi yang digunakan, yaitu:
•    SIMD
•    SIMD
•    MISD
•    MIMD

SISD

Yang merupakan singkatan dari Single Instruction, Single Data adalah satu-satunya yang menggunakan arsitektur Von Neumann. Ini dikarenakan pada model ini hanya digunakan 1 processor saja. Oleh karena itu model ini bisa dikatakan sebagai model untuk komputasi tunggal. Sedangkan ketiga model lainnya merupakan komputasi paralel yang menggunakan beberapa processor. Beberapa contoh komputer yang menggunakan model SISD adalah UNIVAC1, IBM 360, CDC 7600, Cray 1 dan PDP 1.

SIMD

Yang merupakan singkatan dari Single Instruction, Multiple Data. SIMD menggunakan banyak processor dengan instruksi yang sama, namun setiap processor mengolah data yang berbeda. Sebagai contoh kita ingin mencari angka 27 pada deretan angka yang terdiri dari 100 angka, dan kita menggunakan 5 processor. Pada setiap processor kita menggunakan algoritma atau perintah yang sama, namun data yang diproses berbeda. Misalnya processor 1 mengolah data dari deretan / urutan pertama hingga urutan ke 20, processor 2 mengolah data dari urutan 21 sampai urutan 40, begitu pun untuk processor-processor yang lain. Beberapa contoh komputer yang menggunakan model SIMD adalah ILLIAC IV, MasPar, Cray X-MP, Cray Y-MP, Thingking Machine CM-2 dan Cell Processor (GPU).

MISD

Yang merupakan singkatan dari Multiple Instruction, Single Data. MISD menggunakan banyak processor dengan setiap processor menggunakan instruksi yang berbeda namun mengolah data yang sama. Hal ini merupakan kebalikan dari model SIMD. Untuk contoh, kita bisa menggunakan kasus yang sama pada contoh model SIMD namun cara penyelesaian yang berbeda. Pada MISD jika pada komputer pertama, kedua, ketiga, keempat dan kelima sama-sama mengolah data dari urutan 1-100, namun algoritma yang digunakan untuk teknik pencariannya berbeda di setiap processor. Sampai saat ini belum ada komputer yang menggunakan model MISD.

MIMD

Yang merupakan singkatan dari Multiple Instruction, Multiple Data. MIMD menggunakan banyak processor dengan setiap processor memiliki instruksi yang berbeda dan mengolah data yang berbeda. Namun banyak komputer yang menggunakan model MIMD juga memasukkan komponen untuk model SIMD. Beberapa komputer yang menggunakan model MIMD adalah IBM POWER5, HP/Compaq AlphaServer, Intel IA32, AMD Opteron, Cray XT3 dan IBM BG/L.
Singkatnya untuk perbedaan antara komputasi tunggal dengan komputasi paralel, bisa digambarkan pada gambar di bawah ini:



Penyelesaian Sebuah Masalah pada Komputasi Tunggal

Penyelesaian Sebuah Masalah pada Komputasi Paralel

Dari perbedaan kedua gambar di atas, kita dapat menyimpulkan bahwa ki-nerja komputasi paralel lebih efektif dan dapat menghemat waktu untuk pe-mrosesan data yang banyak daripada komputasi tunggal.Dari penjelasan-penjelasan di atas, kita bisa mendapatkan jawaban mengapa dan kapan kita perlu menggunakan komputasi paralel. Jawabannya adalah karena komputa-si paralel jauh lebih menghemat waktu dan sangat efektif ketika kita harus mengolah data dalam jumlah yang besar. Namun keefektifan akan hilang ke-tika kita hanya mengolah data dalam jumlah yang kecil, karena data dengan jumlah kecil atau sedikit lebih efektif jika kita menggunakan komputasi tunggal.

Sumber :
http://coretanmuvi.blogspot.com/2012/03/paralel-processing.html

Komentar Pribadi :

Setelah saya membaca artikel di atas ,menurut saya komputasi parallel atau parallel procesing dapat digunakan untuk mengolah data yang jumlahnya sangat besar atau dibutuhkanya proses komputasi yang cukup banyak. Peralatan yang biasanya digunakan adalah terdiri dari beberapa komputer yang dihubungkan oleh jaringan dan mampu bekereja secara paralel untuk menyelesaikan suatu masalah.

Intinya pada paralel processing perintah atau instruksi dapat dikerjakan secara bersamaan.untuk kelebihan pada artikel ini terdapat pada isi atau kontent yang dibahas cukup jelas.sedangkan untuk kekurangan pada artikel ini mungkin dari segi penggunaan dan penulisan bahasanya sedikit kurang tepat / bagus. Alangkah lebih baik jika penulis juga memperhatikan pen-uliasan dan penggunaan bahasa yang lebih baik.

Sabtu, 27 April 2013

Sabar is Success

Sabar. Tentunya kata tersebut sudah tidak asing di telinga kita. Namun, sudahkah kita tahu apa yang dimaksud dengan sabar? Dalam Kamus Besar Bahasa Indonesia, sabar diartikan tahan menghadapi cobaan (tidak lekas marah, tidak lekas putus asa, tidak lekas patah hati); tabah, tenang; tidak tergesa-gesa; tidak terburu nafsu.
 
Sabar merupakan salah satu kunci kesuksesan. Kesuksesan sendiri diartikan sebagai sebuah keberhasilan. Seseorang yang sabar cenderung tidak tergesa-gesa dalam melakukan sesuatu. Hal ini lah yang menyebabkan seseorang membuka pemikirannya mengenai hal-hal yang sebaiknya dilakukan serta mempertimbangkan terlebih dahulu apa dampak dari perbuatan yang hendak dilakukannya.
 
Lebih dari itu, seseorang yang sabar cenderung memiliki jiwa yang besar yang menjadikan seseorang itu sukses. Orang yang sabar tidak akan menyerah jika ia dihadapkan pada sebuah kegagalan, bahkan ia menganggap kegagalan sebagai suatu jembatan yang dapat mengantarkannya kepada keberhasilan.
 
Tentunya ‘sabar’ yang penulis maksud bukan lah berserah diri tanpa tindakan apa pun. Sabar di sini, yaitu sabar dalam berusaha dan bekerja keras untuk mencapai sebuah kesuksesan.
 
Sabar dan kesuksesan akan selalu berbanding lurus. Semakin kita bersabar, maka akan semakin besar pula jalan menuju kesuksesan. Sabar jangan hanya diartikan sebagai sesuatu hal yang lemah tetapi justru sesuatu hal yang memiliki kekuatan besar di dalamnya.
 
Lantas darimana kah kita mulai bersabar? Jawabannya adalah mulai dari hal-hal kecil. Jangan biarkan hal-hal yang memancing emosi kita menjadi penghambat untuk kehidupan kita. Satu hal lagi yang terpenting sabar itu tidak mengenal batas karena pada hakikatnya kemampuan manusia dalam membangun kesabaran lah yang terbatas. Kuncinya jangan batasi diri kita dalam bersabar karena sabar is success.

Macam - Macam Komputasi Modern

1. Mobile Computing atau Komputasi Bergerak
Mobile computing (komputasi bergerak) merupakan kemajuan teknologi komputer sehingga dapat berkomunikasi menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel serta mudah dibawa atau berpindah tempat, tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel. Berdasarkan penjelasan tersebut, untuk kemajuan teknologi ke arah yang lebih dinamis membutuhkan perubahan dari sisi manusia maupun alat. Contoh dari mobile computing adalah GPS, smart phone, dan sebagainya.

2. Grid Computing
Komputasi grid memanfaatkan kekuatan pengolahan idle berbagai unit komputer, dan menggunakan kekuatan proses untuk menghitung satu pekerjaan. Pekerjaan itu sendiri dikontrol oleh satu komputer utama, dan dipecah menjadi beberapa tugas yang dapat dilaksanakan secara bersamaan pada komputer yang berbeda. Tugas-tugas ini tidak perlu saling eksklusif, meskipun itu adalah skenario yang ideal. Sebagai tugas lengkap pada berbagai unit komputasi, hasil dikirim kembali ke unit pengendali, yang kemudian collates itu membentuk keluaran kohesif. Keuntungan dari komputasi grid adalah dua kali lipat: pertama, kekuatan pemrosesan yang tidak digunakan secara efektif digunakan, memaksimalkan sumber daya yang tersedia dan, kedua, waktu yang dibutuhkan untuk menyelesaikan pekerjaan besar berkurang secara signifikan.

3.Cloud Computing
Cloud computing adalah perluasan dari konsep pemrograman berorientasi objek abstraksi. Abstraksi, sebagaimana dijelaskan sebelumnya, menghapus rincian kerja yang kompleks dari visibilitas. Semua yang terlihat adalah sebuah antarmuka, yang menerima masukan dan memberikan output. Bagaimana output ini dihitung benar-benar tersembunyi. Sebagai contoh, seorang sopir mobil tahu bahwa roda kemudi dengan memutar arah mobil yang mereka ingin pergi; atau yang menekan pedal gas akan menyebabkan mobil untuk mempercepat. Sopir biasanya tidak peduli tentang bagaimana arah dari roda kemudi dan pedal gas tersebut diterjemahkan ke dalam gerakan yang sebenarnya dari mobil. Oleh karena itu, rincian ini diabstraksikan dari sopir.

Sumber :


http://adit2602.blogspot.com/2013/04/pengertian-sejarah-dan-macam-macam.html

Sejarah Komputasi Modern


Komputasi Modern pertama kali digagasi oleh John Von Neumann. Beliau di lahirkan di Budapest, ibukota Hungaria pada 28 Desember 1903 dengan nama Neumann Janos. Karya – karya yang dihasilkan adalah karya dalam bidang matematika, teori kuantum, game theory, fisika nuklir, dan ilmu komputer.

Von Neumann telah menjadi ilmuwan besar pada abad 21. Von Neumann meningkatkan karya-karyanya dalam bidang matematika, teori kuantum, game theory, fisika nuklir, dan ilmu komputer. Beliau juga merupakan salah seorang ilmuwan yang sangat berpengaruh dalam pembuatan bom atom di Los Alamos pada Perang Dunia II lalu.

Von Neumann juga belajar di Berlin dan Zurich dan mendapatkan diploma pada bidang teknik kimia pada tahun 1926. Pada tahun yang sama dia mendapatkan gelar doktor pada bidang matematika dari Universitas Budapest. Keahlian Von Neumann terletak pada bidang teori game yang melahirkan konsep seluler automata, teknologi bom atom, dan komputasi modern yang kemudian melahirkan komputer. Kegeniusannya dalam matematika telah terlihat semenjak kecil dengan mampu melakukan pembagian bilangan delapan digit (angka) di dalam kepalanya.
Beliau pernah mengajar di Berlin dan Hamburg, Von Neumann pindah ke Amerika pada tahun 1930 dan bekerja di Universitas Princeton pada saat yang bersamaan Von Neumann menjadi salah satu pendiri Institute for Advanced Studies.

Von Neumann sangat tertarik pada hidrodinamika dan kesulitan penyelesaian persamaan diferensial parsial nonlinier yang digunakan, Von Neumann kemudian beralih dalam bidang komputasi. Von Neumann menjadi seorang konsultan pada pengembangan komputer ENIAC, dia merancang konsep arsitektur komputer yang masih dipakai sampai sekarang. Arsitektur Von Nuemann adalah seperangkat komputer dengan program yang tersimpan (program dan data disimpan pada memori) dengan pengendali pusat, I/O, dan memori.

 Sejarah Perkembangan Komputasi Modern :

•    Konrad Zuse’s electromechanical “Z mesin”. Z3 (1941) adalah sebuah mesin pertama yang menampilkan biner aritmatika, termasuk aritmatika floating point dan ukuran programmability. Pada tahun 1998, Z3 operasional pertama di dunia komputer itu di anggap sebagai Turing lengkap.
•    Berikutnya Non-programmable Atanasoff-Berry Computer yang di temukan pada tahun 1941 alat ini menggunakan tabung hampa berdasarkan perhitungan, angka biner, dan regeneratif memori kapasitor.Penggunaan memori regeneratif diperbolehkan untuk menjadi jauh lebih seragam (berukuran meja besar atau meja kerja).
•    Selanjutnya komputer Colossus ditemukan pada tahun 1943, berkemampuan untuk membatasi kemampuan program pada alat ini menunjukkan bahwa perangkat menggunakan ribuan tabung dapat digunakan lebih baik dan elektronik reprogrammable.Komputer ini digunakan untuk memecahkan kode perang Jerman.
•    The Harvard Mark I ditemukan pada 1944, mempunyai skala besar, merupakan komputer elektromekanis dengan programmability terbatas.
•    Lalu lahirlah US Army’s Ballistic Research Laboratory ENIAC ditemukan pada tahun 1946, komputer ini digunakan unutk menghitung desimal aritmatika dan biasanya disebut sebagai tujuan umum pertama komputer elektronik (ENIAC merupaka generasi yang sudah sangat berkembang di zamannya sejak komputer pertama Konrad Zuse ’s Z3 yang ditemukan padatahun 1941).

Sumber :

http://justz-share.blogspot.com/2013/03/sejarah-komputasi-modern.html

Perkembangan Komputasi Modern

Hampir sebagian besar orang mengetahui apa itu komputer, lain hal nya dengan komputasi. Komputasi sendiri merupakan suatu cara yang dapat digunakan untuk menemukan sebuah solusi dari data yang telah kita input dengan menggunakan algoritma. Dan ilmu komputasi adalah bidang ilmu yang mempunyai perhatian pada penyusunan model matematika teknik penyelesaian numerik serta penggunaan komputer untuk menganalisis dan memecahkan masalah-masalah ilmu (atau dalam hal ini sains). Dalam penggunaan praktisnya, biasanya berupa penerapan simulasi komputer atau berbagai bentuk komputasi lainnya untuk menyelesaikan masalah-masalah dalam berbagai bidang keilmuan, tetapi dalam perkembangannya digunakan juga untuk menemukan prinsip-prinsip baru yang mendasar dalam ilmu.

Sebelum kita masuk pada alat komputasi yang ada pada saat ini, ada lebih baiknya kita melihat contoh komputasi zaman dahulu. Hal ini dapat membantu kita untuk melihat perkembangan komputasi dari generasi ke generasi. Sebagai contoh, dahulu alat komputasi paling kuno adalah kertas, potlot dan karet penghapus. dari ketiga benda tersebut, orang melakukan proses-proses komputasi yang mudah hingga yang rumit dengan tiga benda sederhana ini. Akan tetapi, dengan munculnya alat-alat komputasi yang tersusun dari komponen-komponen elektro; seperti kalkulator dan mesin hitung lainnya, hal-hal komputasi yang rumit akan menjadi lebih sederhana dan memudahkan kita dalam mengerjakan suatu proses perhitungan.

Pada kesempatan ini saya ingin berbagi sedikit informasi tentang satu mesin komputasi yang sangat populer pada era ini, yaitu komputer.

Komputasi Modern
Komputasi modern mungkin merupakan kalimat yang jarang terdengar di telinga masyarakat Indonesia pada umumnya. Komputasi modern pengertiannya adalah cara untuk menemukan pemecahan masalah/solusi dari data input dengan menggunakan suatu algoritma tertentu. Komputasi merupakan suatu sub-bidang dari ilmu komputer dan matematika.

Selama ribuan tahun, perhitungan dan komputasi umumnya dilakukan dengan menggunakan pena dan kertas, atau kapur dan batu tulis, atau dikerjakan secara mental, kadang-kadang dengan bantuan suatu tabel. Sebenarnya sudah lama komputasi modern ini di cetuskan dan tokoh di balik semua ini yaitu John Von Neumann, Beliau merupakan ilmuan besar saat ini. Beliaulah yang pertama kali menggagaskan konsep sebuah sistem yang menerima intruksi-intruksi dan menyimpannya dalam sebuah memory dan dikenal sebagai arsitektur komputer modern.

Komputasi modern digunakan untuk memecahkan suatu masalah yang ada, perhitungan komputasi modern yaitu seperti :

•    Akurasi (bit, floating point)
•    Kecepatan (dalam satuan Hertz - Hz.)
•    Problem volume besar (paralel)
•    Modeling (NN dan GA), dan
•    Kompleksitas (menggunakan Teori Bog O)

Seiring dengan terus berkembangnya komputasi, tentunya akan berpengaruh terhadap penggunaan hardware dan software yang digunakan untuk komputasi tersebut. Sehingga hal ini membuat adanya sebuah evolusi mesin yang digunakan untuk pemrosesan tersebut. Hal - hal yang berdampak akibat berkembangnya komputasi ini akan dijelaskan pada artikel selanjutnya.

Sedikit kesimpulan yang bisa saya tarik dari sekelumit artikel ini adalah bahwa jauh sebelum dikenalnya mesin untuk melakukan proses komputasi (dalam hal ini seperti kalkulator, komputer, dan gadget lainnya), orang dahulu telah memanfaatkan benda - benda sekitar bahkan benda - benda langit untuk melakukan sebuah perhitungan. Sebagai contoh, bangsa suku Maya yang hidup sekitar 1000 tahun yang lalu telah memanfaatkan benda langit untuk digunakan sebagai navigasi dan sistem penanggalan dan ketelitiannya pun sangat akurat.

Sumber :

http://lautansemesta.blogdetik.com/donwload/perkembangan-komputasi-modern/


Komentar Pribadi :

    Setelah saya membaca artikel di atas, menurut saya sebelum adanya konsep komputasi modern seperti saat ini, manusia pada zaman dahulu telah melakukan proses komputasi dengan bantuan alat-alat sederhana seperti, kertas, potlot, dan karet penghapus, namun dapat membantu mereka dalam menyelesaikan proses-proses komputasi dari yang mudah hingga yang rumit.

Seiring dengan kemajuan zaman seperti saat ini proses-proses komputasi yang dilakukan manusia dapat dikerjakan dengan lebih mudah karena adanya komputasi modern yang memiliki akurasi dan kecepatan .dalam prosesnya. Untuk kelebihan pada artikel ini, terdapat pada isi atau konten dari artikel ini seperti adanya gambaran perbandingan antara pengerjaan proses komputasi pada zaman dahulu dengan komputasi modern yang saat ini ada. Sedangkan untuk kekurangan pada artikel ini menurut saya mungkin dari segi penggunaan dan penulisan bahasanya sedikit kurang tepat / bagus. Alangkah lebih baik jika penulis juga memperhatikan penuliasan dan penggunaan bahasa yang lebih baik.


Selasa, 02 April 2013

Bidang - Bidang Yang Terkait Dengan Bioinformatika


Biophysics
Adalah sebuah bidang interdisipliner yang mengalikasikan teknik-teknik dari ilmu Fisika untuk memahami struktur dan fungsi biologi (British Biophysical Society). Disiplin ilmu ini terkait dengan Bioinformatika karena penggunaan teknik-teknik dari ilmu Fisika untuk memahami struktur membutuhkan penggunaan TI.

Computational Biology
Computational biology merupakan bagian dari Bioinformatika (dalam arti yang paling luas) yang paling dekat dengan bidang Biologi umum klasik. Fokus dari computational biology adalah gerak evolusi, populasi, dan biologi teoritis daripada biomedis dalam molekul dan sel.

Medical Informatics
Menurut Aamir Zakaria [ZAKARIA2004] Pengertian dari medical informatics adalah “sebuah disiplin ilmu yang baru yang didefinisikan sebagai pembelajaran, penemuan, dan implementasi dari struktur dan algoritma untuk meningkatkan komunikasi, pengertian dan manajemen informasi medis.” Medical informatics lebih memperhatikan struktur dan algoritma untuk pengolahan data medis, dibandingkan dengan data itu sendiri. Disiplin ilmu ini, untuk alasan praktis, kemungkinan besar berkaitan dengan data-data yang didapatkan pada level biologi yang lebih “rumit”.

Cheminformatics
Cheminformatics adalah kombinasi dari sintesis kimia, penyaringan biologis, dan pendekatan data-mining yang digunakan untuk penemuan dan pengembangan obat (Cambridge Healthech Institute’s Sixth Annual Cheminformatics conference). Kemungkinan penggunaan TI untuk merencanakan secara cerdas dan dengan mengotomatiskan proses-proses yang terkait dengan sintesis kimiawi dari komponenkomponen pengobatan merupakan suatu prospek yang sangat menarik bagi ahli kimia dan ahli biokimia.

Genomics
Genomics adalah bidang ilmu yang ada sebelum selesainya sekuen genom, kecuali dalam bentuk yang paling kasar. Genomics adalah setiap usaha untukmenganalisa atau membandingkan seluruh komplemen genetik dari satu spesies atau lebih. Secara logis tentu saja mungkin untuk membandingkan genom-genom dengan membandingkan kurang lebih suatu himpunan bagian dari gen di dalam genom yang representatif.

Mathematical Biology
Mathematical biology juga menangani masalah-masalah biologi, namun metode yang digunakan untuk menangani masalah tersebut tidak perlu secara numerik dan tidak perlu diimplementasikan dalam software maupun hardware.
Menurut Alex Kasman [KASMAN2004] Secara umum mathematical biology melingkupi semua ketertarikan teoritis yang tidak perlu merupakan sesuatu yang beralgoritma, dan tidak perlu dalam bentuk molekul, dan tidak perlu berguna dalam menganalisis data yang terkumpul.

Proteomics
Istilah proteomics pertama kali digunakan untuk menggambarkan himpunan dari protein-protein yang tersusun (encoded) oleh genom. Michael J. Dunn [DUNN2004], mendefiniskan kata “proteome” sebagai: “The PROTEin complement of the genOME“. Dan mendefinisikan proteomics berkaitan dengan: “studi kuantitatif dan kualitatif dari ekspresi gen di level dari protein-protein fungsional itu sendiri”. Yaitu: “sebuah antarmuka antara biokimia protein dengan biologi molekul”.

Pharmacogenomics
Pharmacogenomics adalah aplikasi dari pendekatan genomik dan teknologi pada identifikasi dari target-target obat. Contohnya meliputi menjaring semua genom untuk penerima yang potensial dengan menggunakan cara Bioinformatika, atau dengan menyelidiki bentuk pola dari ekspresi gen di dalam baik patogen maupun induk selama terjadinya infeksi, atau maupun dengan memeriksa karakteristik pola-pola ekspresi yang ditemukan dalam tumor atau contoh dari pasien untuk kepentingan diagnosa (kemungkinan untuk mengejar target potensial terapi kanker).
Istilah pharmacogenomics digunakan lebih untuk urusan yang lebih “trivial” — tetapi dapat diargumentasikan lebih berguna– dari aplikasi pendekatan Bioinformatika pada pengkatalogan dan pemrosesan informasi yang berkaitan dengan ilmu Farmasi dan Genetika, untuk contohnya adalah pengumpulan informasi pasien dalam database.

Pharmacogenetics
Pharmacogenetics adalah bagian dari pharmacogenomics yang menggunakan metode genomik/Bioinformatika untuk mengidentifikasi hubungan-hubungan genomik, contohnya SNP (Single Nucleotide Polymorphisms), karakteristik dari profil respons pasien tertentu dan menggunakan informasi-informasi tersebut untuk memberitahu administrasi dan pengembangan terapi pengobatan.
Gambaran dari sebagian bidang-bidang yang terkait dengan Bioinformatika di atas memperlihatkan bahwa Bioinformatika mempunyai ruang lingkup yang sangat luas dan mempunyai peran yang sangat besar dalam bidangnya. Bahkan pada bidang pelayanan kesehatan Bioinformatika menimbulkan disiplin ilmu baru yang menyebabkan peningkatan pelayanan kesehatan.

Sumber :

Komentar Pribadi:

Setelah mengetahui bidang-bidang yang menerapkan bioinformatika di dalamnya, ternyata disiplin ilmu ini memiliki ruang lingkup yang sangat luas. Bioinformatika menggunakan tinjauan berbagai sudut pandang ilmu yang relevan dalam memecahkan masalah yang ada di berbagai bidang, seperti bidang-bidang di atas contohnya.


PENERAPAN BIOINFORMATIKA DALAM BIDANG BUDIDAYA PERAIRAN


Bioinformatika (bahasa Inggris: bioinformatics) adalah (ilmu yang mempelajari) penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Contoh topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen.

Istilah bioinformatics mulai dikemukakan pada pertengahan era 1980-an untuk mengacu pada penerapan komputer dalam biologi. Namun demikian, penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika (seperti pembuatan basis data dan pengembangan algoritma untuk analisis sekuens biologis) sudah dilakukan sejak tahun 1960-an.

Berikut adalah beberapa contoh penerapan bioinformatika dalam bidang
budidaya:
A. Teknologi ekspresi protein
Produksi protein rekombinan sedang hangat dalam bidang bioteknologi. Ada berbagai metoda yang dapat dipilih sebagai sistem ekspresi antara lain pendekatan bakterial, yeast (ragi),  sel insekta maupun transgenik. Banyak produk sebagai contoh hormon, gonadotropin dan enzym telah digunakan dalam akuakultur. Ekspresi antigen untuk pengembangan vaksin mewakili pula kegiatan dalam bidang ini.

B. Mikrosatelit, RFLP, Analisis QTL
Teknologi “sidik jari” DNA dan pemetaan DNA semakin mempermudah perkembangan ilmu dalam akuakultur.  Teknologi tersebut digunakan untuk identifikasi stok, seleksi dalam kegiatan breeding, dan mengidentifikasi gen yang penting dalam akuakultur seperti pertumbuhan dan resistensi terhadap penyakit. Pemetaan dan karakterisasi gen semakin dipermudah dengan adanya teknologi QTL (Quantitative Trait Loci).

C. Vaksin DNA
Kegiatan ini melibatkan pengunaan DNA untuk mengekspresikan antigen dalam inang sebagai bagian dari proses vaksinasi. Teknologi ini telah diterapkan dalam skala penelitian pada rainbow trout dan hasilnya sangat bagus. Ketika di uji tantang dengan virus IHNV, hampir 100% ikan dengan  perlakuan teknologi ini selamat dan perlakuan kontrol 85-90% mengalami kematian.

D. Chip DNA
Teknologi baru ini mampu menganalisa ekspresi ribuan gen dalam satu microchip. Teknologi ini berkembang pesat dan telah diaplikasikan untuk ekspresi gen, pemetaan, penemuan gen, diagnosa genetik. Dalam akuakultur sudah ada beberapa grup riset yang menggunakan teknologi ini untuk meneliti ekspresi gen pada ikan.  
E. Proteomics
Proteomic adalah ilmu yang mempelajari sifat protein (tingkat ekspresi,  interaksi, modifikasi setelah translasi dan lainnya) dalam skala besar untuk memperoleh pandangan jelas dan terintegrasi sebagai contoh untuk mengetahui proses yang menyebabkan penyakit, meneliti proses-proses dalam sel, networking pada skala protein. Teknologi ini adalah kombinasi dari elektroforesis “2D” polyacrilamide gel dengan spektrometer. Ditunjang oleh teknologi komputer untuk mengolah data dan bioinformatika, teknologi ini menjadi metoda yang cepat dan sensitif untuk mengetahui karakterisasi protein. Kesimpulannya teknologi ini bisa mengidentifikasi protein yang dapat berperan untuk penemuan obat, theurapeutics dan lainnya.

F. Teknologi Transgenik
Teknologi transgenik telah digunakan sejak 1980 dan sekarang berkembang memproduksi makhluk hidup dengan fenotip yang diinginkan. Dalam bidang akuakultur teknologi ini berguna untuk meningkatkan laju pertumbuhan ikan; mengatur kematangan gonad, diferensiasi sex dan sterilitas; meningkatkan resistensi terhadap pathogen; mengadaptasi ikan terhadap lingkungan baru (freeze resistance!); merubah karakteristik biokimia dari daging ikan sehingga menciptakan rasa daging yang diinginkan; mengubah jalur metabolisme sehingga terjadi efisiensi pakan.


Sumber :

Komentar Pribadi :
Setelah saya membaca artikel di atas, menurut saya Bioinformatika merupakan gabungan disiplin ilmu antara ilmu biologi dan teknologi informasi. Gabungan keduanya sangat berguna untuk berbagai bidang, salah satunya pada bidang budidaya perairan yang menjadi topik pembahasan artikel ini. Salah satu contoh penerapanya adalah Teknologi Transgenik. Teknologi ini secara umum berguna untuk meningkatkan laju pertumbuhan ikan, yang berarti jika laju pertumbuhanya tinggi maka usia panen pada ikan akan semakin cepat dan pembudidya dapat melepasnya ke pasaran.